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An Bord der „Admiral Graf Spee“ sammelte Töniges bereits 1936 erste Einsatzerfahrung. Als Schnellbootkommandant kämpfte er ab 1940 im Kanal gegen feindliche Zerstörer und Torpedoboote. In der, gemessen an ihrer Größe, kampfkräftigsten Waffengattung der Kriegsmarine zeigte Töniges sein Können im Schwarzen Meer im Kampf gegen russische Transport- und Kriegsschiffe. Am 13. November 1942 mit dem Eichenlaub zum Ritterkreuz ausgezeichnet, gab er hernach sein Wissen als Ausbilder und Referent an der Marineschule Flensburg-Mürwik weiter.